Ainda não temos significados para "молиться в душе".
1Я, молясь в душе, чтобы он меня не узнал и не связал нашей командой, трусовато поднял руки ладонями перед собой и отрицающе помотал головой.
2- Ничего страшного, - вздохнув, сказала Катя, молясь в душе, чтобы он уже, наконец, оставил её в покое, - все в порядке.